Barbour Sweden,Barbour På Vintern

SYFTE: Carrier screening för recessiva mendelska störningar sysselsätter traditionellt fokuserat genotypning att förhöra begränsade uppsättningar av mutationer är mest Barbour På Vintern utbredda i vissa etniska grupper. Vi försökt utveckla nästa generations DNA-sekvensebaserad arbetsflöde för att möjliggöra analys av ett mer omfattande uppsättning sjukdomsalstrande mutations.METHODS: Vi utnyttjade molekylära inversionssonder för att fånga de protein kodande regioner av 15 gener från genomiskt DNA isolerat från hela blod och sekvenser dessa regioner med hjälp Barbour Sweden av Illumina HiSeq 2000 (Illumina, San Diego, CA). För att bedöma kvaliteten på den resulterande data, mätte vi både den del av målområdet som ger högkvalitativa genotyp samtal, och känsligheten och specificiteten hos dessa samtal i jämförelse med konventionell Sanger-sekvensering över hundratals prover. Slutligen, för att förbättra den totala noggrannheten för att upptäcka isättningar och deletioner, introducerar vi en ny församling baserat tillvägagångssätt som väsentligt ökar känsligheten utan att minska specificity.RESULTS: Vi genererade högkvalitativa sekvens för minst 99,8% av den riktade baspar i prover som härrör från blod och uppnått hög överensstämmelse med Sanger-sekvensering (känslighet \u0026 gt; 99,9%, specificitet \u0026 gt; 99,999%). Vår nya algoritmen kan upptäcka insättningar och deletioner otillgängliga av ström methods.CONCLUSION: Vår nästa generations DNA-sekvensebaserat tillvägagångssätt ger den noggrannhet och fullständighet som krävs för en bärare screeningtest.